Change in vibrational entropy with change in protein volume estimated with mode Grüneisen parameters

نویسندگان

چکیده

For a small adjustment in average volume, due to change state of protein or other macromolecule at constant temperature, the vibrational entropy is related mode Grüneisen parameters, which relate shifts frequency volume change. We report here values parameters computed for two hydrated proteins, cytochrome c and myoglobin, exhibit trends with resembling those glassy systems. use volumetric thermal expansion previously isothermal compressibility several proteins. also estimate changes resulting from upon ligand bonding myoglobin homodimeric hemoglobin Scapharca inaequivalvis (HbI). compare estimates ligation obtained terms results normal analysis earlier molecular dynamics simulations HbI. The illustrate how can yield that contribute binding allostery.

برای دانلود رایگان متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

qfd planning with cost consideration in fuzzy environment

در عصر حاضر که رقابت بین سازمان ها بسیار گسترش یافته است، مطالعه و طرحریزی سیستم های تولیدی و خدماتی به منظور بهینه سازی عملکرد آنها اجتناب ناپذیر می باشد. بخش عمده ای از رقابت پذیری سازمان ها نتیجه رضایتمندی مشتریان آنها است. میزان موفقیت سازمان های امروزی به تلاش آنها در جهت شناسایی خواسته ها و نیازهای مشتریان و ارضای این نیازها بستگی دارد. از طرفی کوتاه کردن زمان ارائه محصول/خدمات به مشتریان...

15 صفحه اول

Change Detection in Partially Observed Nonlinear Dynamic Systems with Unknown Change Parameters (with Proofs)

We study the change detection problem in partially observed nonlinear dynamic systems. We assume that the change parameters are unknown and the change could be gradual (slow) or sudden (drastic). For most nonlinear systems, no finite dimensional filters exist and approximation filtering methods like the Particle Filter are used. Even when change parameters are unknown, drastic changes can be de...

متن کامل

Uniprocessor EDF Scheduling with Mode Change

Consider the problem of scheduling sporadically-arriving tasks with implicit deadlines using Earliest-Deadline-First (EDF) on a single processor. The system may undergo changes in its operational modes and therefore the characteristics of the task set may change at run-time. We consider a well-established previously published mode-change protocol by Sha et al. and we show that if every mode uti...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Journal of Chemical Physics

سال: 2021

ISSN: ['1520-9032', '1089-7690', '0021-9606']

DOI: https://doi.org/10.1063/5.0039175